Saya tidak tahu tingkat Python murni yang ingin Anda gunakan untuk menyalin, tetapi Anda dapat mendelegasikan seluruh operasi pipa ke shell.
subprocess.Popen('mysqldump -h localhost -P 3306 -u -root mydb | mysql -h localhost -P 3306 -u root mydb2', shell=True)
Ini akan bekerja dengan cara yang sama ketika Anda menjalankannya di shell.