Pendapat pribadi:Anda tidak boleh menggunakan MyISAM untuk sesuatu yang baru. InnoDB mendukung banyak fitur yang tidak dimiliki MyISAM, yang paling penting adalah transaksi, diikuti oleh integritas referensial dan banyak item lainnya.
Banyak orang akan mencoba berargumen bahwa MyISAM lebih cepat dan masih memiliki tempat, tetapi a) kesenjangan itu telah sangat tertutup, dan percepatan dapat dilakukan di luar database (yaitu, memcached, dll), dan b) database yang cepat dengan data yang buruk tidak terlalu berguna.