JSON yang diformat khusus dari MYSQL PDO untuk digunakan di NVD3.js

Anda harus membuat array baru dengan struktur ini sebelum menyandikannya sebagai objek json. Ini akan berhasil (array berformat baru Anda ada di $new_array, jadi Anda bisa menyandikannya dengan json):

$new_array = array();
foreach($pdo_response as $bf) {
            if(empty($new_array[$bf['volume_name']])) {
                    $new_array[$bf['volume_name']] = array("key" => $bf['volume_name'], "values" => array());
            }
    $new_array[$bf['volume_name']]['values'][] = array("x" => $bf['recoreded'], "y" => $bf['volume_files_used']);
}

Manfaatkan array_values() jika Anda menginginkan kunci numerik (0 - ....) untuk dimensi pertama.