Anda benar, Anda tidak dapat memanggil alias Anda dalam klausa WHERE atau HAVING, tetapi selain itu saya tidak yakin apa yang Anda maksud; GROUP BY dan HAVING dimaksudkan untuk digunakan bersama:
SELECT a.ID, sum(b.Qty*b.Price) AS Subtotal
FROM tbl_One AS a
LEFT JOIN tbl_Two AS b ON b.TwoID = a.ID
GROUP BY a.ID
HAVING sum(b.Qty*b.Price) > 100 AND sum(b.Qty*b.Price) < 200