Tidak yakin mengapa Anda ingin melakukannya seperti ini, ada cara yang lebih baik tetapi untuk menjawab pertanyaan Anda lakukan seperti ini:
$queryDel = "
delete from inscription where NUM_INSCRIPTION= $NUM_INSCRIPTION ;
delete from bource where ID_BOURCE = $ID_BOURCE ;
delete from class where ID_CLASS = $ID_CLASS ;
delete from project where ID_PROJECT = $ID_PROJECT ;
delete from annee_scolaire where ID_ANNEE = $ID_ANNEE ;
delete from eleve where CIN_ELEVE = '$InputCIN'; ";
$result=mysqli_multi_query($con,$queryDel);
dan juga ingat untuk menghapus hasil jika tidak, Anda tidak akan dapat melakukan kueri lain, tetapi saya rasa penghapusan tidak akan mengembalikan hasil.
while(mysqli_next_result($con)){;} //clear any remaining query results.
juga ingat bahwa jika satu kueri gagal, semua kueri lainnya tidak akan berjalan. jadi untuk men-debug, coba jalankan setiap kueri secara terpisah terlebih dahulu dan pastikan semuanya berfungsi karena ini adalah pernyataan hapus, buat cadangan basis data Anda sebelum menjalankan kueri dan pulihkan jika diperlukan.