Saya setuju dengan cgwyllie Anda harus menulis layanan web yang akan bertindak sebagai API ke database Anda dengan metode yang mengembalikan JSON (atau XML).
Metode layanan web kemudian dapat dipanggil dari proyek PhoneGap Anda (saya akan merekomendasikan untuk melihat jquery ajax api http://api.jquery.com/jQuery.ajax/ ).
Saya hanya akan menulis layanan web dalam PHP atau bahasa apa pun yang Anda kenal.