Menggunakan LEFT JOIN/IS NULL:
DELETE b FROM BLOB b
LEFT JOIN FILES f ON f.id = b.fileid
WHERE f.id IS NULL
Menggunakan NOT EXISTS:
DELETE FROM BLOB
WHERE NOT EXISTS(SELECT NULL
FROM FILES f
WHERE f.id = fileid)
Menggunakan NOT IN:
DELETE FROM BLOB
WHERE fileid NOT IN (SELECT f.id
FROM FILES f)
Peringatan
Kapan pun memungkinkan, lakukan DELETE dalam transaksi (dengan asumsi didukung - IE:Not on MyISAM) sehingga Anda dapat menggunakan rollback untuk mengembalikan perubahan jika terjadi masalah.