Selain jawaban ini jika Anda perlu mengubah tableB.value menjadi tableA.value secara dinamis dapat Anda lakukan misalnya:
UPDATE tableB
INNER JOIN tableA ON tableB.name = tableA.name
SET tableB.value = IF(tableA.value > 0, tableA.value, tableB.value)
WHERE tableA.name = 'Joe'