Ini mungkin bukan yang paling efisien, tetapi saya akan membuat tabel temp untuk menyimpan hasil dari proc yang disimpan dan kemudian menggunakannya dalam gabungan terhadap tabel target. Misalnya:
CREATE TABLE #t (uniqueid int)
INSERT INTO #t EXEC p_YourStoredProc
UPDATE TargetTable
SET a.FlagColumn = 1
FROM TargetTable a JOIN #t b
ON a.uniqueid = b.uniqueid
DROP TABLE #t