Oracle
 sql >> Teknologi Basis Data >  >> RDS >> Oracle

Percepat to_sql() saat menulis Pandas DataFrame ke database Oracle menggunakan SqlAlchemy dan cx_Oracle

Pandas + SQLAlchemy per default menyimpan semua object (string) kolom sebagai CLOB di Oracle DB, yang membuat penyisipan sangat lambat.

Berikut beberapa tesnya:

import pandas as pd
import cx_Oracle
from sqlalchemy import types, create_engine

#######################################################
### DB connection strings config
#######################################################
tns = """
  (DESCRIPTION =
    (ADDRESS = (PROTOCOL = TCP)(HOST = my-db-scan)(PORT = 1521))
    (CONNECT_DATA =
      (SERVER = DEDICATED)
      (SERVICE_NAME = my_service_name)
    )
  )
"""

usr = "test"
pwd = "my_oracle_password"

engine = create_engine('oracle+cx_oracle://%s:%[email protected]%s' % (usr, pwd, tns))

# sample DF [shape: `(2000, 11)`]
# i took your 2 rows DF and replicated it: `df = pd.concat([df]* 10**3, ignore_index=True)`
df = pd.read_csv('/path/to/file.csv')

Info DF:

In [61]: df.shape
Out[61]: (2000, 11)

In [62]: df.info()
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 2000 entries, 0 to 1999
Data columns (total 11 columns):
id               2000 non-null int64
name             2000 non-null object
premium          2000 non-null float64
created_date     2000 non-null datetime64[ns]
init_p           2000 non-null float64
term_number      2000 non-null int64
uprate           1000 non-null float64
value            2000 non-null int64
score            2000 non-null float64
group            2000 non-null int64
action_reason    2000 non-null object
dtypes: datetime64[ns](1), float64(4), int64(4), object(2)
memory usage: 172.0+ KB

Mari kita periksa berapa lama waktu yang dibutuhkan untuk menyimpannya ke Oracle DB:

In [57]: df.shape
Out[57]: (2000, 11)

In [58]: %timeit -n 1 -r 1 df.to_sql('test_table', engine, index=False, if_exists='replace')
1 loop, best of 1: 16 s per loop

Di Oracle DB (perhatikan CLOB):

AAA> desc test.test_table
 Name                            Null?    Type
 ------------------------------- -------- ------------------
 ID                                       NUMBER(19)
 NAME                                     CLOB        #  !!!
 PREMIUM                                  FLOAT(126)
 CREATED_DATE                             DATE
 INIT_P                                   FLOAT(126)
 TERM_NUMBER                              NUMBER(19)
 UPRATE                                   FLOAT(126)
 VALUE                                    NUMBER(19)
 SCORE                                    FLOAT(126)
 group                                    NUMBER(19)
 ACTION_REASON                            CLOB        #  !!!

Sekarang mari kita instruksikan panda untuk menyimpan semua object kolom sebagai tipe data VARCHAR:

In [59]: dtyp = {c:types.VARCHAR(df[c].str.len().max())
    ...:         for c in df.columns[df.dtypes == 'object'].tolist()}
    ...:

In [60]: %timeit -n 1 -r 1 df.to_sql('test_table', engine, index=False, if_exists='replace', dtype=dtyp)
1 loop, best of 1: 335 ms per loop

Kali ini kira-kira. 48 kali lebih cepat

Cek di Oracle DB:

 AAA> desc test.test_table
 Name                          Null?    Type
 ----------------------------- -------- ---------------------
 ID                                     NUMBER(19)
 NAME                                   VARCHAR2(13 CHAR)        #  !!!
 PREMIUM                                FLOAT(126)
 CREATED_DATE                           DATE
 INIT_P                                 FLOAT(126)
 TERM_NUMBER                            NUMBER(19)
 UPRATE                                 FLOAT(126)
 VALUE                                  NUMBER(19)
 SCORE                                  FLOAT(126)
 group                                  NUMBER(19)
 ACTION_REASON                          VARCHAR2(8 CHAR)        #  !!!

Mari kita uji dengan 200.000 baris DF:

In [69]: df.shape
Out[69]: (200000, 11)

In [70]: %timeit -n 1 -r 1 df.to_sql('test_table', engine, index=False, if_exists='replace', dtype=dtyp, chunksize=10**4)
1 loop, best of 1: 4.68 s per loop

Butuh ~5 detik untuk 200 ribu baris DF di lingkungan pengujian saya (bukan yang tercepat).

Kesimpulan: gunakan trik berikut untuk secara eksplisit menentukan dtype untuk semua kolom DF dari object dtype saat menyimpan DataFrames ke Oracle DB. Jika tidak, itu akan disimpan sebagai tipe data CLOB, yang memerlukan perlakuan khusus dan membuatnya sangat lambat

dtyp = {c:types.VARCHAR(df[c].str.len().max())
        for c in df.columns[df.dtypes == 'object'].tolist()}

df.to_sql(..., dtype=dtyp)


  1. Database
  2.   
  3. Mysql
  4.   
  5. Oracle
  6.   
  7. Sqlserver
  8.   
  9. PostgreSQL
  10.   
  11. Access
  12.   
  13. SQLite
  14.   
  15. MariaDB
  1. Mendapatkan kesalahan ORA - 00907 pada hal berikut di ON UPDATE

  2. Oracle SQL, gabungkan beberapa kolom + tambahkan teks

  3. Menggunakan IS NULL atau IS NOT NULL pada kondisi join - Pertanyaan teori

  4. Cari Semua Bidang Di Semua Tabel Untuk Nilai Tertentu (Oracle)

  5. Perbedaan antara literal N'String' vs U'String' di Oracle