masalahnya ada di sini
const app = require("../index.js"); // the express server
Setiap kali Anda mencoba meminta index.js
Anda secara teknis copy paste semua kode dari dalam index.js
ke skrip pengujian Anda.
Karena Anda menjalankan beberapa file pengujian secara bersamaan, setiap pengujian mencoba menjalankan kode yang sama di dalam index.js
Anda dapat membaca lebih lanjut tentang http://fredkschott ini. com/post/2014/06/require-and-the-module-system/