Baiklah, ada bendera baru yang diperkenalkan di 3.6 untuk kasus spesifik yang Anda miliki. Ini dinonaktifkan secara default.
Setel tanda ini jika Anda ingin menggunakan indeks
mongod --setParameter internalQueryPlannerGenerateCoveredWholeIndexScans=1
Info lebih lanjut di sini &di sini