ganti bagian ini:
$result=array();
while($row=mysqli_fetch_array($res)){
array_push($result,array('id'=>$row[0],'timeIn'=>$row[1],'timeOut'=>$row[2]));
}
echo (json_encode(array("result"=>$result)));
dengan:
echo json_encode($res);
Anda membuat banyak array, ketika Anda membuat Push in while loop Anda mendorong array di $result array, kemudian ketika Anda echo Anda meletakkan semua hasil di array lain. dan ini lebih kompleks.