Kegigihan WebSphere MQ selalu merupakan sistem file lokal untuk platform terdistribusi. Di mainframe ada kemungkinan menggunakan database DB2 di Sysplex dengan Fasilitas Kopling tetapi untuk yang lainnya itu adalah sistem file.
Juga, tidak ada persistensi lokal untuk klien WebSphere MQ. Hanya pengelola antrian yang akan menyimpan pesan.
Dalam keluarga WebSphere, Bus Integrasi Sistem Server Aplikasi WebSphere memiliki kemampuan untuk menggunakan database untuk persistensi pesannya. SIBus adalah implementasi JMS yang disediakan dengan WAS untuk bertukar pesan di sel WAS dan antara instance WAS.
