Saya tidak berpikir Anda bisa melewatkan perilaku itu. Anda secara teknis meneruskan string, jadi CI menafsirkannya seperti itu dan hanya mengapitnya dengan tanda kutip.
Saya pikir Anda lebih baik hanya menggabungkan $empIDs dengan tangan (misalnya menggunakan foreach loop), keluar dari mereka dengan $this->db->escape() jika Anda ingin memastikan.