Saya memutuskan untuk tetap menyimpan data di S3 tetapi seorang teman mengarahkan saya ke arah solusi untuk masalah ini, saya mengujinya dan berhasil, jadi saya pikir saya harus mempostingnya di sini kalau-kalau ada orang lain yang mengalami permasalahan yang sama.
Pada dasarnya masalahnya disebabkan oleh variabel max_allowed_packet disetel ke sesuatu yang lebih kecil dari ukuran bidang blog/teks. Kueri tidak dapat dijalankan sehingga koneksi terputus. Berikut adalah beberapa detail tentang variabel max_allowed_packet
http://dev.mysql.com /doc/refman/5.0/en/server-system-variables.html#sysvar_max_allowed_packet
dan juga beberapa info tentang menyesuaikannya pada instance rds
http://www.henrybaxter.ca/?p=111