Dengan JPA Anda perlu melakukan seperti mengikuti
int num = ((Number)this.entityManager.createNativeQuery("select count(*) from your_table_name")
.getSingleResult()).intValue();
diedit :
String name = this.entityManager.createNativeQuery("select t.name from your_table_name t limit 1").getSingleResult().toString();
Anda akan mendapatkan hitungan dengan objek num
Semoga dapat membantu Anda.