Saya memiliki masalah yang sama. Saya menyelesaikannya dengan melakukan CHANGE COLUMN (atau MODIFY COLUMN) sebelum ADD COLUMN.
Dalam contoh Anda yang akan memberikan pernyataan SQL berikut:
ALTER TABLE `logs`
CHANGE COLUMN `created` `created` DATETIME NULL DEFAULT NULL AFTER `category`,
ADD COLUMN `updated` DATETIME NULL DEFAULT NULL AFTER `created`;