Gunakan lsof -i TCP:3306
atau netstat -lp | grep 3306
untuk mengetahui apa yang sudah didengarkan di port 3306 - pasti ada sesuatu yang mendengarkannya.
Anda dapat mempertimbangkan untuk menatap server pada port yang berbeda (edit my.cnf dan ubah port default di sana).
Anda mungkin perlu menjalankan ini sebagai root, yaitu sudo lsof -i TCP:3306