Dengan asumsi tidak ada masalah kutipan CSV:
$newStr = str_replace( ',', '<br>', $string );
EDIT:
Setelah melihat rollback Anda, saya melihat bahwa Anda sebenarnya ingin mengganti , dengan newline karakter seperti \r , \n atau \r\n :
$newStr = str_replace( ',', "\n", $string );