Saya pikir Anda terlalu memperumit hal-hal dengan loop do/while Anda.
Coba perulangan while yang sederhana sebagai gantinya:
$pdo = /* connection stuff here */
$sql = "select 1; select 2; select 3; select 4;";
$statement = $pdo->query($sql);
while($rowset = $statement->fetchAll()){
//do stuff
$statement->nextRowset();
}
Ini akan terus berulang sementara rowset tidak memiliki nilai salah yang kemudian akan bekerja persis seperti yang Anda harapkan.