MySQL Workbench berjalan di Windows dan Linux. Versi komersial akan memungkinkan Anda merekayasa balik dan mengedit struktur database langsung, dengan yang gratis Anda harus terlebih dahulu membuang struktur ke file. Nenek moyangnya DBDesigner sedikit lebih tua, tetapi tidak memiliki batasan ini. Windows dan Linux juga.
Jika keduanya berlebihan, Anda dapat mencoba dengan HeidiSQL , turunan dari MySQLFront. Ini hanya berjalan di Windows, tetapi ada versi alfa yang berjalan di Java.