Ya, Anda dapat menukar mesin seperti pakaian dalam bekas, jika Anda suka, tanpa banyak kesulitan. Ubah saja di phpmyadmin.
Tapi saya tidak akan mengubahnya demi mengubahnya. Apakah Anda perlu menggunakan kunci asing? Ubahlah. Apakah Anda memerlukan penguncian tingkat baris alih-alih penguncian tabel? Ubahlah.
Perlu dicatat bahwa ada alasan bagus untuk menggunakan MyISAM juga. Lihatlah pengindeksan FULLTEXT. Anda tidak dapat melakukannya dengan InnoDB.
PERBARUI
Pada MySQL 5.6 FULLTEXT telah diimplementasikan untuk tabel InnoDB juga. Berikut adalah manual .