Saya tidak yakin, tetapi saya kira Anda menggunakan tabel INNODB, dan Anda belum melakukan komit. Saya percaya MySQLdb mengaktifkan transaksi secara otomatis.
Panggil conn.commit()
sebelum memanggil close
.
Dari FAQ:Mulai dengan 1.2.0, MySQLdb menonaktifkan autocommit secara default