Saya memiliki masalah kinerja yang serupa dengan mysql dan menyelesaikannya dengan menyetel useServerPrepStmts dan rewriteBatchedStatements properti di url koneksi.
Connection c = DriverManager.getConnection("jdbc:mysql://host:3306/db?useServerPrepStmts=false&rewriteBatchedStatements=true", "username", "password");