Ini tampaknya menjadi masalah yang terkait dengan RDS, di mana setelah beberapa menit saya melihat bahwa tambalan diterapkan ke RDS melalui log peristiwa. Setelah patch diterapkan, jalankan alter extension postgis update
perintah berhasil memutakhirkan ekstensi PostGIS. Menutup pertanyaan ini untuk saat ini.