Jika Anda tidak perlu melakukan ini dalam SQL, Anda cukup mengurutkan daftar objek yang dikembalikan secara langsung dengan python.
Contoh (menggunakan diurutkan python fungsi)
results = session.query(user).filter(user.id.in_(A)).all()
results = sorted(results, key=lambda o: A.index(o.id))