Baru saja menemukan jawabannya di utas ini:PHPMyAdmin - Jumlah catatan total bervariasi
Tampaknya menambahkan parameter konfigurasi di config.inc.php berhasil:http://www.kavoir.com/2012/07/make-phpmyadmin-show-exact-number-of-records-for-innodb-tables.html
Cukup tambahkan baris ini di config.inc.php:
$cfg['MaxExactCount'] = 2000000;
Sehingga setiap tabel InnoDB dengan kurang dari 2000000 baris akan memiliki jumlah baris yang tepat ditampilkan.
Buat jumlah ini cukup besar dan semua tabel InnoDB di database Anda akan memiliki jumlah baris yang tepat di halaman database phpMyAdmin.