Masalahnya hanyalah phpMyAdmin mengirim ulang data dengan cara yang tidak biasa. Basis data sekarang berfungsi seperti yang diharapkan dan kueri seperti:
SELECT * WHERE ... AND sector = "Energy"
berjalan jauh lebih cepat.
Terima kasih kepada Drew, Uueerdo, Rick James, dan semua orang yang telah membantu saya memahami masalah ini.