Berkat bertrand saya dapat menemukan bahwa jawabannya terletak pada 'Projection '. Di mongodb itu '$ ', di luwak select . Inilah cara saya membuatnya bekerja:
User.findOne({id: req.body.myId}).select({ Friends: {$elemMatch: {id: req.body.id}}}),
Itu hanya mengembalikan elemen yang cocok dengan id yang ditentukan di teman.