Dalam hal kinerja perbedaan akan kecil di terbaik. Karena kenyataan bahwa alamat email Anda unik, indeks majemuk apa pun yang memiliki bidang email tidak akan pernah lebih membantu daripada indeks pada alamat email saja. Alasan untuk ini adalah bahwa bidang email Anda sudah memiliki kardinalitas maksimal untuk koleksi Anda dan bidang indeks lebih lanjut tidak akan membantu database untuk menyaring catatan lebih cepat karena akan selalu sampai pada dokumen yang benar hanya dengan bidang email.
Dalam hal penggunaan memori (yang sangat penting untuk database seperti MongoDB) indeks email saja juga jauh lebih kecil.
TL;DR :Gunakan indeks pada alamat email saja.
