Saya juga mengalami masalah ini. Dan itu disebabkan oleh peningkatan mongodb tanpa mematikan server mongo.
Sekarang Anda sudah memiliki mongodb versi baru (beri tahu dari versi shell mongo). Anda dapat menyelesaikannya hanya dengan memulai ulang mongod proses.
Untuk memulai dan menghentikan proses mongo, lihat https://docs.mongodb.com/manual/tutorial/manage-mongodb-processes
