MongoDB 3.2 (Dirilis pada November 2015) menawarkan mesin penyimpanan terenkripsi. Tidak perlu menggunakan API pihak ketiga untuk mengenkripsi data Anda sebelum memasukkan atau mengenkripsi seluruh drive. Anda dapat menemukan detail lebih lanjut di sini. Namun, perhatikan bahwa ini hanya ditawarkan untuk edisi Enterprise saja.
Ia bekerja dengan mesin penyimpanan WiredTiger, yang telah disertakan sebagai alternatif mesin penyimpanan MMAPv1 default sejak 3.0. Jika database Anda masih menggunakan MMAPv1, baca panduan ini untuk mengetahui langkah-langkah mengonversi database dari MMAPv1 ke WiredTiger.
Seperti yang dicatat Fernando Paz dalam komentar, penyimpanan terenkripsi hanya tersedia di edisi MongoDB Enterprise.