Jawaban sebelumnya tidak berfungsi di MongoDB 3.4+. Cara yang tepat untuk melakukan ini di versi 3.4 dan di atasnya adalah dengan membuat BasicDBObject dan menggunakannya sebagai parameter Database.runCommand(). Ini contohnya.
final BasicDBObject command = new BasicDBObject();
command.put("eval", String.format("function() { %s return;}}, {entity_id : 1, value : 1, type : 1}).forEach(someFun); }", code));
Document result = database.runCommand(command);